E-commerce en Bourgogne-Franche-Comté – Mai 2025 : 3 660 entreprises analysées
Bourgogne-Franche-Comté et le digital : terroir et innovation

La région Bourgogne-Franche-Comté compte 3 660 entreprises e-commerce, représentant 3,6% du marché national. Cette région se distingue par une forte spécialisation agroalimentaire et une adoption progressive du digital par les acteurs traditionnels du terroir.
Chiffres clés régionaux :
- 3 660 entreprises e-commerce actives
- 10e rang national pour le nombre d'entreprises digitales
- Modèle dominant : B2C (65,8% des entreprises)
- CMS privilégié : WooCommerce (46,1% des sites)
Répartition par département
Départements leaders en Bourgogne-Franche-Comté
- Côte-d'Or (21) : 881 entreprises (24,1% du total régional)
- Services professionnels : 532 entreprises (60,4%)
- B2B développé : 498 entreprises (56,5%)
- Food & Beverage : 344 entreprises (39,0%) - Spécialité viticole
- CMS : WooCommerce 45,9%, PrestaShop 25,5%, Shopify 17,3%
- Saône-et-Loire (71) : 728 entreprises (19,9% du total régional)
- B2B dominant : 402 entreprises (55,2%)
- Services professionnels : 384 entreprises (52,7%)
- Maison & jardin développé : 283 entreprises (38,9%)
- CMS : WooCommerce 48,1%, PrestaShop 27,2%, Shopify 13,3%
- Doubs (25) : 641 entreprises (17,5% du total régional)
- Équilibre services/B2B : 388 entreprises chacun (60,5%)
- Maison & jardin : 266 entreprises (41,5%)
- CMS : WooCommerce 44,6%, PrestaShop 28,2%, Shopify 20,1%
- Yonne (89) : 426 entreprises (11,6% du total régional)
- B2B dominant : 244 entreprises (57,3%)
- Services professionnels : 232 entreprises (54,5%)
- CMS : WooCommerce 47,4%, PrestaShop 20,0%, Shopify 18,5%
- Jura (39) : 333 entreprises (9,1% du total régional)
- B2B : 187 entreprises (56,2%)
- Travel & Hospitality : 180 entreprises (54,1%) - Spécialité montagne
- CMS : WooCommerce 49,8%, PrestaShop 22,8%, Shopify 17,4%
- Nièvre (58) : 245 entreprises (6,7% du total régional)
- Haute-Saône (70) : 228 entreprises (6,2% du total régional)
- Territoire de Belfort (90) : 178 entreprises (4,9% du total régional)
Analyse des verticales en Bourgogne-Franche-Comté
Secteurs dominants régionaux
Secteurs transversaux :
- Services Professionnels : Présents dans tous les départements (50-60%)
- Business to Business : Forte tradition industrielle (55-60% par département)
- Maison & Jardin : Secteur rural développé (35-45% selon départements)
Spécialisations territoriales marquées :
- Alimentation & Boissons : 1 193 entreprises (32,6%)
- Concentration unique en France pour une région de cette taille
- Spécialité viticole bourguignonne digitalisée
- Tradition gastronomique française
- Produits du Terroir : 603 entreprises (16,5%)
- Valorisation numérique des spécialités locales
- Circuit court et vente directe
- Authenticity marketing
- Tourisme & Hôtellerie : Fort dans le Jura (54,1%)
- Économie montagnarde digitalisée
- Tourisme vert et thermal
- Patrimoine UNESCO (vignoble de Bourgogne)
Technologies e-commerce privilégiées
CMS les plus utilisés en Bourgogne-Franche-Comté
- WooCommerce : 1 689 sites (46,1%)
- PrestaShop : 936 sites (25,6%)
- Shopify : 618 sites (16,9%)
- Magento : Sites restants (minoritaire)
Spécificités régionales :Bourgogne-Franche-Comté affiche un profil technologique traditionnel avec WooCommerce largement dominant (46,1%) et PrestaShop résistant (25,6%), reflétant l'adoption progressive du digital par les acteurs établis du territoire.
Comparaison nationale : PrestaShop y représente 25,6% vs 17,9% en Île-de-France, témoignant de la préférence pour les solutions françaises dans les territoires traditionnels.
Modèles business en Bourgogne-Franche-Comté
B2B vs B2C vs D2C
- B2B : 597 entreprises (16,3%)
- Tradition industrielle forte (métallurgie, agroalimentaire)
- Digitalisation des filières traditionnelles
- B2C : 2 407 entreprises (65,8%)
- Secteur dominant orienté consommation
- Tourisme et produits du terroir
- D2C : 656 entreprises (17,9%)
- Valorisation directe des productions locales
- Circuit court viticole et agroalimentaire
Analyse comparative
La répartition 16,3% B2B / 65,8% B2C / 17,9% D2C révèle une région orientée grand public avec une forte composante terroir en vente directe, caractéristique des régions rurales à forte identité gastronomique.
Focus départemental approfondi
Côte-d'Or (21) - Le cœur viticole digital
Avec 881 entreprises e-commerce, la Côte-d'Or représente 24,1% de l'écosystème digital régional et concentre l'essentiel de la filière viticole bourguignonne digitalisée.
Spécialisation agroalimentaire unique :
- Food & Beverage : 344 entreprises (39,0% du département)
- Concentration nationale pour une région de cette taille
- Digitalisation des domaines viticoles et maisons de négoce
Profil technologique équilibré :
- WooCommerce : 404 sites (45,9%) - Légèrement sous la moyenne régionale
- PrestaShop : 225 sites (25,5%) - Solutions françaises privilégiées
- Shopify : 152 sites (17,3%) - Adoption modérée
Saône-et-Loire (71) - L'équilibre industriel-rural
728 entreprises avec un profil B2B dominant (55,2%), reflétant le tissu industriel local, complété par un secteur Maison & Jardin développé (38,9%).
Doubs (25) - Le pôle urbain comtois
641 entreprises présentant l'équilibre parfait services professionnels/B2B (60,5% chacun), témoignant de la diversification économique autour de l'aire urbaine Besançon-Montbéliard.
Jura (39) - La spécialisation touristique
333 entreprises avec une spécialisation Tourism & Hospitality unique (54,1% des entreprises du département), illustrant la digitalisation réussie de l'économie montagnarde jurassienne.
Spécificités départementales remarquables
Spécialisations sectorielles territoriales
Côte-d'Or - Capital viticole digital :
- 39,0% d'entreprises Food & Beverage vs 15-25% ailleurs
- Digitalisation des domaines et caves
- E-œnotourisme développé
Jura - Économie montagnarde connectée :
- 54,1% d'entreprises Tourism & Hospitality
- Stations de ski et thermalisme digital
- Produits du terroir (comté, vins du Jura)
Saône-et-Loire - Diversification réussie :
- 38,9% Maison & Jardin (record régional)
- Artisanat et production locale
- Équilibre industrie/services
Contrastes technologiques par territoire
WooCommerce plus fort en zones rurales :
- Jura : 49,8% vs 46,1% moyenne régionale
- Yonne : 47,4%
- Adaptation aux besoins locaux
PrestaShop résistant dans l'industrie :
- Doubs : 28,2% vs 25,6% moyenne régionale
- Solutions françaises privilégiées
- Secteur B2B traditionnel
Shopify émergent en zones touristiques :
- Doubs : 20,1% (le plus élevé de la région)
- Modernisation progressive
Concentration géographique
Triptyque départemental dominant :
- Top 3 départements : 61,5% du total régional
- Côte-d'Or + Saône-et-Loire + Doubs = 2 250 entreprises
- Axe Dijon-Mâcon-Besançon structurant
Développement territorial équilibré :
- 5 départements restants : 38,5% des entreprises
- Répartition homogène (5-12% chacun)
- Potentiel rural significatif
Adoption technologique progressive
Solutions françaises privilégiées :
- PrestaShop : 25,6% vs 17,9% Île-de-France
- Confiance dans l'écosystème national
- Accompagnement local développé
Modernisation mesurée :
- Shopify : 16,9% (adoption progressive)
- WooCommerce dominant mais stable
- Évolution douce vers le SaaS
Tendances et spécificités régionales
Points forts de Bourgogne-Franche-Comté
- Terroir digital : Leader français de l'agroalimentaire e-commerce
- Authenticité : Valorisation numérique des traditions
- Équilibre territorial : Développement homogène
- Stabilité technologique : Adoption progressive et raisonnée
Axes de développement
- E-œnotourisme : Potentiel touristique sous-exploité
- Export digital : Rayonnement international des produits
- Innovation agrotech : Modernisation de la filière
Comparaison nationale
Position de Bourgogne-Franche-Comté
- 10e région française avec 3,6% du marché national
- Leadership agroalimentaire disproportionné vs taille économique
- Spécialisation assumée plutôt que diversification
- Innovation mesurée adaptée au territoire
Aller plus loin
Analyses par région en mai 2025
- E-commerce en Auvergne Rhône Alpes (14 773 entreprises)
- E-commerce en Ile de France (26 488 entreprises)
- E-commerce en Occitanie (11 434 entreprises)
- E-commerce en Nouvelle Aquitaine ( 9 179 entreprises)
- E-commerce dans les Pays de la Loire (5 789 entreprises)
- E-commerce dans le Grand Est (7 665 entreprises)
- E-commerce en PACA (10 144 entreprises)
- E-commerce en Centre Val de Loire (3 496 entreprises)
- E-commerce en Bretagne ( 5 221 entreprises)
- Ecommerce en Hauts de France (6 977 entreprises)
- E-commerce en Normandie (3 913 entreprises)
Retour à l'analyse nationale
Méthodologie : Identification des boutiques Ecommerce par la technologie CMS et rapprochement avec les entreprises via les mentions légales (SIRET/SIREN/numéro de TVA). Celles les entreprises en vie sont gardées lors de l'analyse.